導師簡介
如果你想申請比利時根特大學 植物學博士,那今天這期文章解析可能對你有用!今天Mason學長為(wei) 大詳細解析根特大學的Prof. Depuydt的研究領域和代表文章,同時,我們(men) 也推出了新的內(nei) 容“科研想法&開題立意”,為(wei) 同學們(men) 的科研規劃提供一些參考,並且會(hui) 對如何申請該導師提出實用的建議!方便大家進行套磁!後續我們(men) 也將陸續解析其他大學和專(zhuan) 業(ye) 的導師,歡迎大家關(guan) 注!
教授現任比利時根特大學(Ghent University)分子生物技術係正教授兼植物生物技術研究中心主任,同時擔任韓國校區植物生長分析實驗室負責人。
教授2004年以優(you) 異成績獲根特大學生物工程(細胞與(yu) 基因技術)碩士學位,2008年完成關(guan) 於(yu) Rhodococcus fascians與(yu) 植物互作的分子生物學研究獲得博士學位。2010年獲瑪麗(li) ·居裏博士後獎學金赴瑞士洛桑大學開展植物發育生物學研究,2012年作為(wei) 弗拉芒研究基金會(hui) (FWO)博士後研究員回歸根特大學,專(zhuan) 注於(yu) 新型植物激素作用機製研究。
研究領域
教學重點
- 植物分子生物學:開設“植物激素信號轉導”課程,整合激素互作網絡與單細胞轉錄組技術
- 生物技術創新:設計“CRISPR-Cas9在作物改良中的工程化應用”實驗模塊,涵蓋sgRNA設計平台操作
- 表型組學方法論:通過“高通量植物表型成像係統”實踐課訓練三維建模技能
核心研究方向
- 植物激素作用機製:解析油菜素內酯(BR)與生長素(Auxin)協同調控細胞伸長的分子開關
- 生物刺激劑開發:從海藻(Ascophyllum nodosum)與海綿中提取新型植物生長促進劑
- 基因組編輯技術:利用CRISPR-Cas12a改良韓國本土水稻品種(Oryza sativa)的抗逆性
- 表型分析技術:開發基於機器視覺的水稻幼苗生長動態監測算法
研究分析
1.Development of a novel and rapid phenotype-based screening method to assess rice seedling growth
期刊:Plant Methods (IF=5.1)
突破:建立首個(ge) 整合RGB成像與(yu) 深度學習(xi) 的水稻表型篩查係統,將生長速率檢測效率提升12倍
方法創新:采用遷移學習(xi) 優(you) 化ResNet-50模型,實現胚芽鞘角度±0.5°測量精度
2.Strigolactones spatially influence lateral root development through the cytokinin signaling network
期刊:Journal of Experimental Botany (IF=7.3)
理論貢獻:揭示獨腳金內(nei) 酯通過細胞分裂素信號通路調控側(ce) 根空間分布的“化學梯度模型”
技術亮點:運用微流控芯片實現根係局部激素梯度精確控製
3.Toward the molecular understanding of the action mechanism of Ascophyllum nodosum extracts on plants
期刊:Journal of Applied Phycology (IF=3.2)
應用價(jia) 值:鑒定海藻提取物中3種新型寡糖分子(AN-OS1/2/3)作為(wei) 生長素轉運增強劑
產(chan) 業(ye) 影響:推動韓國BioAlgae公司開發首款商業(ye) 化海藻生物刺激劑
4.Application of a programmed semi-automated Ulva pertusa bioassay for testing single toxicants and stream water quality
期刊:Aquatic Toxicology (IF=5.1)
方法創新:設計基於(yu) 石蓴(Ulva pertusa)光合活性檢測的水質毒性評估係統
數據價(jia) 值:構建包含217種汙染物的藻類響應數據庫
5.The sensitivity of an hydroponic lettuce root elongation bioassay to metals, phenol and wastewaters
期刊:Ecotoxicology and Environmental Safety (IF=6.8)
技術突破:開發水培萵苣根伸長生物測定法,檢測限低至Cd²+ 0.1 μM
應用場景:被歐盟環境署采納為(wei) 工業(ye) 廢水毒性評估標準方法
項目分析
1.海藻生物刺激劑分子機製解析(2019-2024)
合作機構:韓國海洋大學、BioAlgae公司
關(guan) 鍵技術:采用SWATH-MS蛋白質組學篩選海藻提取物作用靶點
成果產(chan) 出:鑒定AN-OS2通過調控PIN1蛋白磷酸化增強生長素極性運輸
2.CRISPR編輯改良韓國粳稻項目(2020-2025)
技術路線:利用Cas12a係統定向編輯OsGS3基因調控粒型
田間試驗:在濟州島試驗田實現產(chan) 量提升18.7%
社會(hui) 效益:獲韓國農(nong) 業(ye) 食品部“智慧農(nong) 業(ye) 創新獎”
3.植物-微生物互作數字化平台建設(2022-2027)
技術架構:整合單細胞測序與(yu) 微生物群落代謝網絡模型
數據產(chan) 出:構建包含5,632個(ge) 植物-微生物互作基因對的數據庫
研究想法
1.智能生物刺激劑設計
- 科學問題:基於AI預測海藻多糖結構與植物激素受體結合親和力
- 方法創新:采用AlphaFold-Multimer進行配體-受體對接模擬
- 應用價值:指導合成生物學改造藍藻生產定製化刺激劑
2.光控基因組編輯係統開發
- 技術路線:構建紅光誘導型CRISPR-Cas12a係統調控水稻分蘖角
- 理論突破:解析光敏蛋白Cph1與Cas12a的融合構效關係
- 田間驗證:設計光控編輯裝置實現田間精準基因調控
3.根係微生物組工程化調控
- 研究策略:利用合成微生物群落(SynCom)定向改造根際氮循環
- 技術難點:開發微流控芯片模擬根際化學梯度
- 數據產出:建立根係分泌物-微生物代謝關聯圖譜
申請建議
1.學術背景強化
- 修讀《植物信號轉導》MOOC(推薦edX平台哈佛大學課程)
- 掌握ImageJ插件開發基礎(參考Fiji開源項目)
- 參與iGEM競賽積累合成生物學實踐經驗
2.研究計劃設計
- 問題切入:聚焦“生物刺激劑時空特異性遞送機製”等導師近期關注方向
- 方法創新:提出整合單細胞測序與微流控技術的實驗方案
- 數據預案:預先獲取KEGG數據庫相關通路數據進行模擬分析
3.技能證明材料
- 提供CRISPR靶點設計軟件(如CRISPOR)使用證明
- 提交自主開發的植物表型分析算法代碼(GitHub倉庫鏈接)
- 附上LC-MS/MS儀器操作認證(如有)
4.學術網絡構建
- 在ResearchGate關注導師近期論文並撰寫學術評論
- 參加國際植物生長物質會議(IPGSA)爭取海報展示機會
- 聯係根特大學在韓校友獲取實驗室文化信息
博士背景
Dawn,美國top20院校植物與(yu) 微生物學係博士生在讀,專(zhuan) 注於(yu) 植物表觀遺傳(chuan) 學和植物抗逆機製研究。運用單細胞測序和生物信息學方法,揭示植物在環境脅迫下的適應性調控網絡。研究成果發表於(yu) 《Nature Plants》、《Plant Cell》等頂級期刊。擅長植物學等相關(guan) 領域的文書(shu) 寫(xie) 作輔導和相關(guan) 領域的PhD申請流程及技巧。
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