單純生信是否好發?前景如何?

鐺鐺檔,今天是久違的醫學Q&A專(zhuan) 場。生信這兩(liang) 年特別火,可就業(ye) 前景是否真的明朗,單純生信又是否好發?涉及人體(ti) 的菌落標本或者細菌培養(yang) 類研究,是否需要倫(lun) 理?

小e來給您一一解答?

問:單純生信是否好發?前景如何?

答:常規生信文章目前發表前景有限,普遍1-3分。影像學分析、空間轉錄組測序、單細胞測序等,由於(yu) 需要耗費大量經費和需要技術難度門檻,是生信類文章中相對好發的。

生信類的文章當前大的行業(ye) 前景是結合大量測序、機器學習(xi) 以及濕實驗驗證為(wei) 主。小的行業(ye) 前景,一是不斷開發新的分析模型、機器學習(xi) 等更為(wei) 高深的生信分析方法;二是轉為(wei) 分析數據量更多、難度更大、精度更高的測序數據,如空間轉錄組測序、單細胞測序等。

如果是隻發單純生信的話,難度相較於(yu) 之前更大,隻能在小的發展前景上不斷內(nei) 卷。如需要在編程分析上進行提升,使用更高級的分析模型、使用數據量大的疾病模型等等,力求得出更為(wei) 有意義(yi) 、統計分析更嚴(yan) 謹得結論。

不然,單純生信得出來的結論往往重點不夠,可信度較低,需要結合一部分的驗證實驗來發表。或者是不使用公共數據庫,而使用自己納入樣本進行測序的數據庫,相對會(hui) 更好發表。同時,一些分析難度較大的測序數據,如單細胞測序、空間轉錄組測序等等的二次分析的文章發表相對比較容易。

問:涉及人體(ti) 的菌落標本或者細菌培養(yang) 類研究,是否需要倫(lun) 理?

答:嚴(yan) 格來說,凡是實驗過程涉及人體(ti) 以及人體(ti) 來源的樣本、人胚胎幹細胞的科學研究均需通過倫(lun) 理審查。比如對人體(ti) 進行觀察、檢查、治療、收集人體(ti) 組織標本、血液和分泌物、以及對人體(ti) 病理資料和臨(lin) 床資料的回顧性分析、利用人胚胎幹細胞進行研究等,因為(wei) 涉及人倫(lun) 道德、受試者權益和隱私等問題,均需在研究開始前申請倫(lun) 理審查,得到倫(lun) 理委員會(hui) 同意後方可進行試驗。

但根據2023年衛健委刊發《涉及人的生命科學和醫學研究倫(lun) 理審查辦法》文件解讀,考慮到基礎研究活動大多不直接涉及人體(ti) 試驗,部分研究也並不直接涉及研究參與(yu) 者的臨(lin) 床診療信息,借鑒國際通行的做法,為(wei) 提高審查效率,減少科研人員不必要負擔,《辦法》規定了“在使用人的信息數據或者生物樣本、不對人體(ti) 造成傷(shang) 害、不涉及敏感個(ge) 人信息或者商業(ye) 利益的前提下”,部分情形的涉及人的生命科學和醫學研究可以免除倫(lun) 理審查。

如:使用已有的人的生物樣本開展研究,所使用的生物樣本來源符合相關(guan) 法規和倫(lun) 理原則,研究相關(guan) 內(nei) 容和目的在規範的知情同意範圍內(nei) ,且不涉及使用人的生殖細胞、胚胎和生殖性克隆、嵌合、可遺傳(chuan) 的基因操作等活動的。

因此,單純使用已有的菌落標本(如檢驗科已有的大小便標本等),進行體(ti) 外培養(yang) 和研究不需要倫(lun) 理;但是涉及額外人體(ti) 取樣、使用患者臨(lin) 床信息等,需要通過倫(lun) 理。

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