HMS-有害腦活動分類競賽

HMS-有害腦活動分類

對危重病患的癲癇 和其他有害腦活動進行分類

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競賽名稱:

HMS - Harmful Brain Activity Classification

HMS-有害腦活動分類

競賽種類:數據挖掘、生物醫學

競賽地址:

https://www.kaggle.com/competitions/hms-harmful-brain-activity-classification/overview

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競賽目標

該競賽的目標是檢測和分類癲癇和其他類型的有害腦活動。您將開發一個(ge) 模型,該模型經過訓練,能夠識別從(cong) 危重病房患者記錄的腦電圖(EEG)信號中提取的信息。

您的工作可能有助於(yu) 迅速提高腦電圖圖譜分類的準確性,從(cong) 而為(wei) 神經危重護理、癲癇和藥物開發帶來深刻的益處。在這一領域的進展可能使醫生和腦研究人員能夠更快速、更準確地檢測癲癇或其他腦損傷(shang) ,從(cong) 而提供更有效的治療。

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競賽背景

從(cong) 聽診器到舌壓板,醫生依賴許多工具來治療患者。醫生使用腦電圖儀(yi) 與(yu) 危重病患的患者合作,以檢測可能導致腦損傷(shang) 的癲癇和其他類型的腦活動。

目前,腦電圖監測完全依賴專(zhuan) 業(ye) 神經學家的手動分析。盡管無法估量其價(jia) 值,但這種勞動密集型的過程是一個(ge) 主要瓶頸。它不僅(jin) 可能耗時,而且腦電圖記錄的手動審查也昂貴,容易產(chan) 生因疲勞導致的錯誤,並且在不同評審者之間存在可靠性問題,即使這些評審者是專(zhuan) 家。

此次競賽的六個(ge) 感興(xing) 趣的模式包括:

癲癇(SZ)、廣泛的周期性放電(GPD)、單側(ce) 性周期性放電(LPD)、單側(ce) 性節律性δ活動(LRDA)、廣泛的節律性δ活動(GRDA)或“其他”。

在此次比賽中使用的腦電圖片段已經由一組專(zhuan) 家進行了注釋或分類。在某些情況下,專(zhuan) 家對正確標簽完全一致。在其他情況下,專(zhuan) 家意見不一致。我們(men) 將專(zhuan) 家高度一致的部分稱為(wei) “理想化”模式。當大約一半的專(zhuan) 家給出“其他”標簽,而另一半給出剩下的五個(ge) 標簽之一時,我們(men) 稱之為(wei) “原型模式”。在專(zhuan) 家在五個(ge) 命名模式中的兩(liang) 個(ge) 之間大致分歧的情況下,我們(men) 稱之為(wei) “邊緣案例”。

不同專(zhuan) 家一致性水平的腦電圖模式示例:

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請參閱數據選項卡,以獲取每個(ge) 子圖的全屏PDF頁麵。

此圖顯示了具有不同一致性水平的腦電圖模式的選定示例。行按照以下結構:第1行是癲癇,第2行是LPD,第3行是GPD,第4行是LRDA,第5行是GRDA。按列排列,模式的理想化形式的示例在第1列(A)中。這些是具有一致專(zhuan) 家意見的模式。第2列(B)是原型或部分形成的模式。大約一半的評分者將其標記為(wei) IIIC模式之一,另一半標記為(wei) “其他”。第3列和第4列(C、D)是邊緣案例(大約一半的評分者將其標記為(wei) IIIC模式,另一半將其標記為(wei) 另一種IIIC模式)。

對於(yu) B-1,10秒原始腦電圖中有一些混有尖銳放電的節律性δ活動,頻譜圖顯示這個(ge) 片段可能屬於(yu) 癲癇的尾部,因此SZ和“其他”之間的分歧是有道理的。B-2顯示大約1Hz處的額葉定位的尖銳瞬態,但它們(men) 極性相反,表明它們(men) 可能來自非腦源,因此LPD和“其他”(偽(wei) 跡)之間的分歧是有道理的。B-3具有彌漫的半節律性δ背景,伴有形態不佳的低幅度廣泛周期性放電,形態變化不定,屬於(yu) 原型GPD類型模式。B-4顯示不穩定形態的右半腦半節律性δ活動,屬於(yu) 原型LRDA模式。B-5顯示不穩定形態的幾波節律性δ活動,維持時間較短,屬於(yu) 原型GRDA。C-1顯示2Hz LPDs,隨著幅度增加,逐漸演變為(wei) 下層的節律性活動,是LPDs和癲癇初期之間的模式,是邊緣案例。D-1顯示豐(feng) 富的GPDs位於(yu) 抑製的背景之上,頻率為(wei) 1-2Hz。10秒內(nei) 的平均頻率接近1.5Hz,暗示可能是癲癇,另一個(ge) 邊緣案例。C-2在LPDs和GPDs之間劃分。周期性放電的幅度在右側(ce) 較高,但在左側(ce) 也有一些反射。D-2在LPDs和LRDA之間涇渭分明。它既有節奏感,又有周期性放電。在顳部導聯中,它看起來更有節奏感,而在矢狀導聯中,它看起來更有周期性。C-3在GPDs和LRDA之間劃分。δ波的上升支形態尖銳,這些周期性放電在兩(liang) 側(ce) 都能看到。節奏性的δ波在左側(ce) 的幅度似乎較高,但左側(ce) 也有一些活動的反射。D-3在GPDs和GRDA之間劃分。δ波的上升支形態尖銳,上升支和下降支之間的坡度不對稱,是一個(ge) 邊緣案例。C-4在LRDA和癲癇之間劃分。左側(ce) 顯示2Hz LRDA,頻譜圖顯示這個(ge) 片段可能屬於(yu) 癲癇的尾部,是一個(ge) 邊緣案例。D-4在LRDA和GRDA之間劃分。δ波的上升支形態尖銳,左側(ce) 的幅度較大,但右側(ce) 也有一些活動的反射。C-5在GRDA和癲癇之間劃分。它顯示潛在的演變中的節律性δ活動,伴有形態不佳的嵌入式癲癇樣放電,是GRDA和癲癇之間的模式,是一個(ge) 邊緣案例。D-5在GRDA和LPDs之間劃分。有廣泛的節律性δ活動,右側(ce) 的活動略微較大,含有形態不佳的癲癇樣放電,是一個(ge) 邊緣案例。注:腦電圖電極的記錄區域簡寫(xie) 為(wei) LL = 左側(ce) ;RL = 右側(ce) ;LP = 左矢狀;RP = 右矢狀。

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評估標準

提交將根據預測概率與(yu) 觀察目標之間的Kullback-Liebler散度進行評估。

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提交文件

對於(yu) 測試集中的每個(ge) eeg_id,您必須為(wei) 每個(ge) 投票列預測一個(ge) 概率。

文件應包含標題,並具有以下格式:

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數據集描述

本次競賽的目標是在腦電圖(EEG)數據中檢測和分類癲癇和其他類型的有害腦活動。即使是專(zhuan) 家也發現這是一項具有挑戰性的任務,他們(men) 在正確標記方麵經常存在分歧。

這是一場代碼競賽。隻有來自測試集的少數示例可供下載。當評分您的提交時,測試文件夾將被替換為(wei) 包含完整測試集的版本。

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時間線

2024年1月8日 - 開始日期

2024年4月1日 - 參賽截止日期

2024年4月1日 - 團隊合並截止日期

2024年4月8日 - 最終提交截止日期

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獎金

第一名 - 20,000美元

第二名 - 12,000美元

第三名 - 7,000美元

第四名 - 6,000美元

第五名 - 5,000美元

【競賽報名/項目谘詢+微信:mollywei007】

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