香港科技大學 (HKUST)博士申請攻略及PhD導師簡介

導師簡介

如果你想申請香港科技大學 生物醫學係博士，那今天這期文章解析可能對你有用！今天Mason學長為(wei) 大詳細解析香港科技大學的Prof.XIE的研究領域和代表文章，同時，我們(men) 也推出了新的內(nei) 容“科研想法&開題立意”，為(wei) 同學們(men) 的科研規劃提供一些參考，並且會(hui) 對如何申請該導師提出實用的建議！方便大家進行套磁！後續我們(men) 也將陸續解析其他大學和專(zhuan) 業(ye) 的導師，歡迎大家關(guan) 注！

教授現任香港科技大學生命科學部主任教授，同時擔任多個(ge) 重要職務，包括香港科技大學-北京大學深圳醫學中心生物醫學研究所所長以及組織再生與(yu) 工程中心主任。教授擁有紮實的學術背景，於(yu) 1996年在羅格斯大學及新澤西醫學與(yu) 牙科大學獲得分子生物學與(yu) 生物化學博士學位。目前，他持有嘉裏控股科學教授席位，體(ti) 現了其在學術界的崇高地位。

研究領域

教授的主要研究興(xing) 趣集中在幹細胞生物學（Stem cell biology）領域。通過查閱其發表論文和主持項目，可以看出他的研究主要涵蓋以下幾個(ge) 方麵：

1. 幹細胞與微環境（niche）之間的相互作用機製：研究幹細胞如何與周圍環境相互作用以維持自我更新與分化平衡。
2. 生殖幹細胞（Germline Stem Cells）的發育與調控：特別是利用果蠅（Drosophila）卵巢作為模型係統研究生殖幹細胞的調控機製。
3. RNA修飾在幹細胞調控中的作用：例如研究5-甲基胞嘧啶（5mC）等RNA修飾如何影響幹細胞功能。
4. 眼部組織發育與疾病：包括視網膜、睫狀體等眼部組織的發育機製及相關疾病的研究。
5. 幹細胞在組織再生與工程中的應用：探索如何將幹細胞生物學基礎研究轉化為組織工程與再生醫學應用。

研究分析

1.《Niche Tet maintains germline stem cells independently of dioxygenase activity》

（EMBO Journal, 2024）

該研究發現Tet蛋白在果蠅卵巢生殖幹細胞微環境中具有獨立於(yu) 其常規二加氧酶活性的功能，能夠維持生殖幹細胞的穩態。研究表明Tet通過與(yu) 其他分子機製相互作用，以非催化方式調控幹細胞命運，這一發現挑戰了傳(chuan) 統對Tet蛋白功能的認知，為(wei) 理幹細胞調控提供了新視角。

2.《Gap junction-transported cAMP from the niche controls stem cell progeny differentiation》

（Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 2023）

該研究揭示了一種新型幹細胞微環境調控機製——通過縫隙連接傳(chuan) 遞的cAMP信號分子從(cong) 微環境細胞傳(chuan) 遞到幹細胞後代，控製其分化過程。這一發現強調了細胞間通訊在幹細胞調控中的關(guan) 鍵作用，為(wei) 理幹細胞微環境的功能機製提供了重要見。

3.《Multiple niche compartments orchestrate stepwise germline stem cell progeny differentiation》

（Current Biology, 2021）

該研究闡明了果蠅卵巢中不同微環境區域如何協同調控生殖幹細胞後代的逐步分化過程。研究發現，不同的微環境區室通過提供不同的信號分子，精確控製幹細胞後代的分化程序。這項工作對理幹細胞分化的時空調控具有重要意義(yi) 。

4.《Dlp-mediated Hh and Wnt signaling interdependence is critical in the niche for germline stem cell progeny differentiation》

（Science Advances, 2020）

這項研究揭示了Dlp（Dally-like protein）如何在果蠅卵巢微環境中協調Hedgehog和Wnt信號通路的相互依賴性，從(cong) 而調控生殖幹細胞後代分化。研究表明這兩(liang) 條重要發育信號通路的協同作用對於(yu) 精確控製幹細胞命運至關(guan) 重要。

5.《Drosophila YBX1 homolog YPS promotes ovarian germ line stem cell development by preferentially recognizing 5-methylcytosine RNAs》

（Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 2020）

這項研究發現果蠅中YBX1同源蛋白YPS能夠特異性識別含有5-甲基胞嘧啶修飾的RNA，從(cong) 而促進卵巢生殖幹細胞發育。這一發現揭示了RNA表觀修飾在幹細胞調控中的重要作用，為(wei) RNA修飾研究在幹細胞生物學領域開辟了新方向。

6.《NOTCH Signaling Controls Ciliary Body Morphogenesis and Secretion by Directly Regulating Nectin Protein Expression》

（Cell Reports, 2021）

該研究闡明了NOTCH信號通路如何通過直接調控Nectin蛋白表達控製睫狀體(ti) 的形態發生和分泌功能。這項工作揭示了眼部組織發育的關(guan) 鍵調控機製，為(wei) 理相關(guan) 眼部疾病提供了分子基礎。

項目分析

1.《幹細胞與(yu) 微環境互作在組織維持和組織工程中的應用》

（RGC-Theme-based Research Scheme）

這是由教授主導的主題研究計劃，旨在深入探索幹細胞與(yu) 微環境之間的相互作用機製，以及如何將這些基礎研究成果應用於(yu) 組織維持和組織工程領域。該項目匯集了多位研究人員，從(cong) 不同角度研究幹細胞與(yu) 微環境相互作用的分子機製，並探索其在再生醫學中的潛在應用。項目的跨學科性質反映了教授整合不同專(zhuan) 業(ye) 知識決(jue) 複雜生物學問題的能力。

2.《核糖核酸5-甲基胞嘧啶修飾在控製果蠅卵巢生殖細胞發育中的功能研究》

（RGC-General Research Fund）

這項由教授主導的研究旨在探究RNA 5mC修飾在果蠅卵巢生殖細胞發育中的作用機製。研究將揭示RNA表觀修飾如何影響生殖幹細胞的自我更新和分化，這不僅(jin) 有助於(yu) 理基礎的RNA調控機製，也為(wei) 研究人類生殖發育相關(guan) 疾病提供了重要參考。

3.《探究Elav1家族蛋白Rbp9在果蠅卵巢生殖幹細胞分化過程中的功能》

（RGC-General Research Fund）

這項研究專(zhuan) 注於(yu) Elav1家族RNA結合蛋白Rbp9在果蠅卵巢生殖幹細胞分化中的作用。Elav1家族蛋白是重要的RNA結合蛋白，在多種組織的發育中起關(guan) 鍵作用。此項目將闡明Rbp9如何通過調控RNA加工影響生殖幹細胞的命運決(jue) 定，為(wei) 理RNA結合蛋白在幹細胞調控中的作用提供新見。

研究想法

1.幹細胞微環境的時空動態研究

• 利用實時成像和單細胞測序技術結合，研究微環境信號分子、細胞外基質成分和力學特性的時空動態變化如何影響幹細胞命運決定
• 開發可控微環境體外培養係統，模擬不同微環境區室的特性，研究其對幹細胞行為的調控作用
• 探索幹細胞在組織發育、穩態維持和損傷修複不同階段，微環境特性的動態變化及其功能意義

2.RNA修飾在幹細胞命運決(jue) 定中的係統性研究

• 利用高通量測序技術繪製不同類型幹細胞及其後代細胞的RNA修飾全景圖
• 開發靶向RNA修飾的新型工具，精確調控特定RNA的修飾狀態，研究其對幹細胞自我更新和分化的影響
• 探索不同RNA修飾之間的相互作用及協同調控機製，構建RNA修飾調控網絡

3.幹細胞與(yu) 免疫係統相互作用機製

• 研究免疫細胞如何參與構成幹細胞微環境，及其在幹細胞調控中的作用
• 探索幹細胞如何調節局部免疫微環境，影響組織炎症和修複過程
• 開發靶向幹細胞-免疫細胞相互作用的新策略，促進組織再生和疾病治療

4. 幹細胞老化機製與(yu) 幹預策略

• 研究微環境衰老如何影響幹細胞功能，以及幹細胞老化的分子機製
• 探索RNA修飾異常在幹細胞老化中的作用及其調控機製
• 開發針對老化幹細胞微環境的幹預策略，恢複幹細胞功能，促進組織再生

5.模式生物與(yu) 人源組織幹細胞研究的整合

• 將果蠅、斑馬魚等模式生物中發現的幹細胞調控機製轉化到人源幹細胞研究中，驗證其保守性和特異性
• 利用類器官（organoid）技術，研究人源幹細胞與微環境相互作用的特性及其在疾病發生中的作用
• 開發基於人源幹細胞的精準醫療策略，針對個體差異製定個性化幹細胞治療方案

申請建議

1.專(zhuan) 業(ye) 知識準備

• 深入學習幹細胞生物學基礎理論，尤其是幹細胞微環境、RNA調控和發育生物學相關知識
• 熟悉果蠅生殖係統作為研究模型的特點和優勢，了相關實驗技術和研究方法
• 掌握眼部發育和疾病的基本知識，尤其是與幹細胞相關的研究進展

2.技術能力強化

• 掌握分子生物學和細胞生物學基本實驗技能，包括分子克隆、蛋白質分析、細胞培養等
• 學習掌握單細胞測序、高通量測序等組學技術的基本原理和數據分析方法
• 培養生物信息學分析能力，特別是RNA測序和單細胞測序數據分析技能
• 熟悉先進顯微成像技術，包括共聚焦顯微鏡、活體成像等方法

3.研究方向匹配

• 根據自身興趣和背景，選擇與教授研究領域高度相關的研究方向，如幹細胞微環境、RNA修飾或眼部發育
• 提前閱讀教授近期發表的論文，了其研究思路和方法，找到可能的研究切入點
• 思考如何將自己的專業背景與教授的研究方向結合，形成獨特的研究視角

4.跨學科能力培養(yang)

• 培養跨學科思維能力，特別是生物學與計算科學、物理學等領域的交叉知識
• 學習一定的生物統計學和數據可視化技能，這對於析大數據集和展示研究結果至關重要
• 關注幹細胞生物學與再生醫學、組織工程等應用領域的最新進展，思考基礎研究向臨床轉化的途徑

博士背景

Darwin，985生物醫學工程係博士生，專(zhuan) 注於(yu) 合成生物學和再生醫學的交叉研究。擅長運用基因編輯技術和組織工程方法，探索人工器官構建和個(ge) 性化醫療的新途徑。在研究CRISPR-Cas9係統在幹細胞定向分化中的應用方麵取得重要突破。曾獲國家自然科學基金優(you) 秀青年科學基金項目資助，研究成果發表於(yu) 《Nature Biotechnology》和《Biomaterials》等頂級期刊。