科研er的動手能力be like:手搓一台反浩克裝甲

對幾乎所有專(zhuan) 業(ye) 來說,趁手好用的科研工具都可算是決(jue) 定一個(ge) 項目成敗的關(guan) 鍵。但是,如果根本不存在正確的工具,會(hui) 發生什麽(me) 情況呢?

這種“潮流”背後的現實,即現成的工具往往存在不足:它們(men) 要麽(me) 成本太高,要麽(me) 無法完全滿足需求。在相對較新的研究領域,比如納米塑料等尤其如此,資助者和製造商跟不上這些研究的步伐。

不管是funding的壓力還是實驗的需求,新生代的科學家們(men) 正客串起臨(lin) 時工程師的角色他們(men) 從(cong) 頭開始設計和編程機器,以填補自己研究需求的空白。

作為(wei) 未來各大lab的打工人,你一定會(hui) 想:坑爹呢這是!打工我還得自備生產(chan) 工具的嘛。可誰讓現實比人強,這不《Nature》前段時間就有篇文章介紹了三位科研狗“自製裝備”的經驗,希望對廣大童鞋有所幫助——

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進化是我們(men) 擁有的用於(yu) 蛋白質工程最強大的工具之一。就像你可以培育狗來嗅出癌症或培育玫瑰具有某種顏色一樣,你可以在分子水平上指導進化——這對於(yu) 發現蛋白質很有用。

在 MIT 攻讀蛋白質工程博士學位時,我研究了一種名為(wei) PACE(phage-assisted continuous evolution 噬菌體(ti) 輔助連續進化)的技術,這是一種利用病毒進化來設計蛋白質的快速方法。我們(men) 使用了M13噬菌體(ti) ,這是一種感染細菌後能在短短20分鍾繁殖的病毒。

問題在於(yu) 進化是不可靠的:有時生物會(hui) 滅絕,因為(wei) 它們(men) 進化得太慢,跟不上環境的變化。當用它來設計蛋白質時,研究人員需要向生態係統提出適量的挑戰,以推動病毒進化而不殺死它們(men) 。

在攻讀博士學位期間,我設計了一個(ge) 機器人來照顧我的蛋白質的進化。PRANCE(phage and robotics assisted near continuous evolution 噬菌體(ti) &機器輔助的近連續進化)可以同時監測數百個(ge) 不斷進化的群體(ti) 。如果它注意到一個(ge) 種群即將滅絕,它會(hui) 讓環境變得更容易容忍——因此製造更好的蛋白質的命中率會(hui) 從(cong) 0 變成 100。

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PRANCE 隻應用了基本的機器人技術,但卻能完成一些非常酷的事情。作為(wei) 一個(ge) 液體(ti) 處理機器人,它使用移液器來運輸物質。它還使用讀板器來測量微生物種群的發光,以了解它們(men) 是否生機勃勃或即將滅絕。

機器人可能不如人類聰明,但它們(men) 可以 24x7 地進行移液。生物學家往往喜歡複雜的事物,但現實往往是越簡單越好。我在 MIT 建造了兩(liang) 台這樣的機器,在弗朗西斯·克裏克研究所則有另一台。

隻需購買(mai) 、插入並按下按鈕即可的精美桌麵設備和自己手搓儀(yi) 器之間可謂天差地別。建造第二台 PRANCE 機器人是一個(ge) 真正的成熟過程:我們(men) 發現所有我們(men) 不知道的依賴關(guan) 係都很重要。實際上,每當我們(men) 製造新的工具時,事情就會(hui) 變得更容易。

發明來自於(yu) 冒險,你的第一版工具可能簡陋到是用膠帶攢起來的,但隨後你又製作了另一個(ge) 版本,然後又迭代到下一個(ge) 版本……然後某一天你會(hui) 突然發現自己的裝備已經從(cong) 馬克1變成了反浩克裝甲。

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在 NPL,我們(men) 的主要職責是研究、開發和維護測量標準。我的專(zhuan) 業(ye) 領域涉及測量結構,正在與(yu) 英國鐵路運營商 Network Rail 開展合作以升級對全國火車隧道的監控。

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NickMcCormick

英國的鐵路網是維多利亞(ya) 時代工程中的一項壯舉(ju) ,絕大部分建於(yu) 19世紀30到70年代。仍在運營的700條隧道總長約320公裏,其中約有 80% 還是用一兩(liang) 百年前的磚石建造的。考慮到它們(men) 的年齡,高頻率的安全檢查尤為(wei) 重要。

但現實是,隧道檢查仍然像十九世紀那樣靠人眼辨別。工人們(men) 拿著手電穿過隧道,觀察內(nei) 部情況,偶爾用棍子敲擊隧道,看看是否有任何材料鬆動或開始碎裂。工作環境困難且危險;長長的隧道髒亂(luan) 不堪。列車必須停下來等待檢查,幾乎所有工作都在周日淩晨2點至4點之間,否則將造成乘客延誤。

為(wei) 了完成 Network Rail 的委托,我們(men) 開發了名為(wei) DIFCAM Evolution 的高分辨率攝像係統,以此遠程繪製隧道內(nei) 部地圖。該設備基於(yu) 非常複雜的立體(ti) 線掃描相機,可以捕獲全彩圖像,還可以生成高度圖。它可以安裝在火車上,在時速 100 公裏的情況下工作。它掃描隧道表麵,拍攝數千張照片,使我們(men) 能夠評估隧道的形狀和紋理。

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DIFCAM 還能夠幫助識別各種各樣潛在的問題。例如,可以通過隧道高度和砂漿深度的微小變化來檢測有從(cong) 隧道內(nei) 部掉落危險的磚塊。比較一段時間內(nei) 的圖像使我們(men) 能夠監測變化率,預測一塊磚石是否即將倒塌,並確定周圍的砂漿是否仍然足夠。

我們(men) 使用數字圖像相關(guan) 性——在非常高的放大倍率下逐個(ge) 像素地比較兩(liang) 幅圖像,並觀察結構是如何變化的。

最大的挑戰來自穿過隧道時,無法使用 GPS 定位。因此我們(men) 使用車輪上的編碼器來觸發攝像頭,從(cong) 而一次生成一行圖像。我們(men) 還使用特殊的相機來測量設備沿火車軌道床的位置,以提高測量的可靠性。高度比較圖像還可用於(yu) 估計修複可能需要多少材料,然後評估修複是否正確完成。

圖像數據能幫助處理各種各樣的問題。最重要的是,成像使我們(men) 能夠從(cong) 方程式中消除人眼的主觀性。

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2017年,我在阿爾卑斯山上海拔3000多米的鬆布裏克天文台(Sonnblick Observatory)工作,收集和分析雪樣,研究比如冰芯中的有機物,以此揭示大氣變化如何影響氣溶膠和有機物。為(wei) 了準確起見,尋找未受汙染的雪原地帶非常重要,這也是我到鬆布裏克的原因。

我們(men) 蒸發樣本中的水,然後燃燒殘留物並分析蒸汽。結果顯示:到處都發現了塑料納米粒子的證據,主要是聚丙烯和聚對苯二甲酸乙二醇酯,直徑通常小於(yu) 200微米。這讓我意識到需要自己動手開發一台儀(yi) 器,以便更準確地分析這些塑料顆粒。

海洋中的微塑料汙染眾(zhong) 所周知,科學家們(men) 通常使用孔徑大約300微米的網來過濾測量。但最近我們(men) 才意識到塑料會(hui) 碎裂成越來越小的顆粒並通過空氣傳(chuan) 播。用光譜法識別納米尺寸顆粒具有挑戰性,因為(wei) 設備中使用的波長對於(yu) 顆粒尺寸來說太大,並且激光會(hui) 引起太多反射。

我花了三周的時間埋頭編碼。這台基於(yu) TD-PTR-MS(熱解吸 - 質子轉移反應 - 質譜法)方法的機器既是一部物理設備,也是一個(ge) 軟件。物理組件使用真空從(cong) 樣品中除去水分而不汙染樣品。然後,水被轉移到我開發的另一個(ge) 係統中——實際上是一個(ge) 黑匣子,可以像一個(ge) 非常小的烤箱一樣控製溫度。我需要使盒子能夠與(yu) TD-PTR-MS 儀(yi) 器通信,以分析樣品並識別其中發現的塑料痕跡,因此需要定製軟件,然後我又使用開源程序從(cong) 頭開始構建該軟件。

我們(men) 在烏(wu) 得勒支大學(Utrecht University)開發了幾個(ge) 這樣的係統,然後在萊比錫的亥姆霍茲(zi) 環境研究中心(Helmholtz Centre for Environmental Research)也有一個(ge) 。

因為(wei) 這套係統的加持,我現在已獲準招聘博士生,並將項目範圍拓展到城市和鄉(xiang) 村居住空間以及湖泊和海洋中的納米塑料。

【競賽報名/項目谘詢+微信:mollywei007】

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