文章標題:Quorum Sensing Communication: Molecularly Connecting Cells, Their Neighbors, and Even DevicesINTRODUCTION
這篇文章主要告訴我們(men) 關(guan) 於(yu) 群體(ti) 感應(QS),它是一種分子信號傳(chuan) 遞方式,介導基於(yu) 分子的細胞-細胞通信。它解釋了QS網絡如何為(wei) 細菌提供了一種從(cong) 環境中收集信息並根據情報做出決(jue) 定的方法。
文章還討論了這一過程如何能夠被重新連接起來,以實現自主行動,但由分子編程的基因控製。此外,文章還回顧了兩(liang) 個(ge) 特征明確的QS係統及其信號、受體(ti) 、信號轉導機製和目標輸出。總之,文章概述了QS的概念及其在合成生物學和微生物聯合體(ti) 中的潛在應用。
PART ONE
圖1.群體(ti) 感應係統調控機製示意圖
圖a是典型的群體(ti) 感應係統。LuxI產(chan) 生群體(ti) 感應因子AHL1,然後AHL1就會(hui) 積累,當AHL1的濃度達到一定程度後,與(yu) LuxR結合,形成複合物,此複合物啟動熒光素酶操縱子的表達,而且LuxI也在操縱子中,所以就會(hui) 形成一個(ge) 正反饋係統,使得大量AHL生成,將附近的所有細菌產(chan) 生群體(ti) 感應。
圖b是另一種調控機製。AI-2通過轉運體(ti) LsrACDB進入細胞,然後被LsrK磷酸化後,解除LsrR對Lsr轉運體(ti) 基因的抑製,從(cong) 而使得細胞產(chan) 生更多AI轉運體(ti) ,從(cong) 而起到一個(ge) 群體(ti) 感應的效果。
PART TWO
圖2.QS生物傳(chuan) 感器示意圖
這是利用群體(ti) 感應係統來作為(wei) 一種探測環境中的汙染物的生物傳(chuan) 感器。AI啟動QS係統,然後例如重金屬離子等汙染物作為(wei) 信號分子放大QS環路,從(cong) 而激活下遊基因表達,發出光或熒光等信號。
此外,QS還能用來在群體(ti) 中使得特定部分表現出所需要的特性或行為(wei) 。例如操縱AI的濃度,通過QS機製使群體(ti) 中的部分細胞產(chan) 生相同的行為(wei) 。
圖3.QS機製治療機製示例圖
利用QS的治療方法,可以研發一種新型的益生菌,其對病原體(ti) 產(chan) 生的AHL特別敏感(LasR),從(cong) 而利用AHL激活一係列基因表達,產(chan) 生細菌毒素pyoS5,細胞裂解蛋白lysin E7來殺死銅綠假單胞菌。以及抗生物膜酶DspB,可以與(yu) 生物膜靶向的納米體(ti) 結合,從(cong) 而促進生物膜的穿透。
圖4.沙門氏菌治療示例圖
利用沙門菌靶向癌細胞的特性,可以利用工程沙門菌進行治療。但又要防止沙門菌對人體(ti) 的危害,所以采用了一種自殺開關(guan) 設計。當沙門菌的濃度達到一定閾值時,就裂解並釋放出代謝物。同時通過AI-2募集益生菌,從(cong) 而對腫瘤細胞進行殺傷(shang) 。
圖5.QS促進生物合成的例子
G-6-P的代謝可分為(wei) 三個(ge) 途徑,1.肌醇MI的產(chan) 生,2.糖酵解3.磷酸戊糖途徑。隨著種群中AHL的濃度提高,PesaS啟動子會(hui) 被AHL結合的EsaR抑製,然後關(guan) 閉Pfk-1酶的表達,這使得糖酵解被抑製,從(cong) 而產(chan) 生更多的肌醇和葡萄糖酸。
PART THREE
圖6.群體(ti) 感應的合成聯合體(ti) 的應用
課題中利用QS係統構建一個(ge) “與(yu) ”門。圖中,綠色的群體(ti) 1在啟動子PQS1的控製下表達QS1R和AHL2,而激活QS1R從(cong) 而啟動PQS1表達的AHL又由黃色的種群2所表達,所以一個(ge) 群體(ti) 就為(wei) 另一個(ge) 群體(ti) 的基因表達發出所需要的AHL1和2信號,這就形成了一個(ge) 與(yu) 的邏輯開關(guan) 。左上角是利用兩(liang) 種群體(ti) 分別產(chan) 生一種原料從(cong) 而獲得產(chan) 物,右上角是通過控製一個(ge) 種群的增長從(cong) 而調控兩(liang) 個(ge) 種群的增長率。
然而,要使這些係統有效地工作,必須克服一些挑戰。一個(ge) 是信號串擾(左下),例如QS2R可能會(hui) 與(yu) AHL1也具有一定親(qin) 和力,從(cong) 而導致信號的串聯幹擾現象。所以,設立一組正交性的QS係統是很有必要的。例如RPA和TRA之間完全正交,互不幹擾。
另一個(ge) 挑戰是可能存在一部分細菌依靠公共產(chan) 品或集體(ti) 行動來生存而其本身並不貢獻。這可能由QS菌之間相互傳(chuan) 遞毒素而殺死QS突變體(ti) 來實現避免。(右下)。
PART FOUR
圖7.說明群體(ti) 感應係統可應用於(yu) 各種領域
文章中發現,QS介導的通信可以針對真核細胞,甚至是病毒。大腸杆菌LuxR的同源物被證明對哺乳動物宿主產(chan) 生的小分子有反應。植物的相關(guan) 細菌中也發現了許多LuxR的同源物。人結腸細胞係HCT-8表達IL-8,相應非致病性大腸杆菌的AI-2。噬菌體(ti) VP882可以對霍亂(luan) 弧菌產(chan) 生的QS AI做出反應,激活噬菌體(ti) 的裂解程序。
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